培養皿主要有塑料和玻璃兩種材質的，一般來說玻璃材質的培養皿主要是用來培養植物材料、微生物和動物細胞貼壁培養。塑料培養皿多是聚乙烯材料制作而成，有一次性的和多次使用之分，可以用于植物材料培養。細菌培養皿和細胞培養皿的區別其實主要是培養皿內表壁不一樣。

培養皿主要是在醫院、生物制品、食品工業、制藥工業等單位，用于細菌的分離培養、抗菌素效價試驗和穩定性試驗分析等。食品行業使用培養皿主要是為了檢測食品中菌群的數量是否符合國家規定的標準。

在不同的環境中，細菌的分布是不相同的，所以在采集菌種的時候要注意選擇環境，選擇的環境要有一定的代表性。然后就可以將接種好的培養基放在特定的環境條件下進行培養。